在2013年中央补助地方科技基础条件专项《福建省对台种质资源隔离检疫共性技术平台及亚热带珍稀种质资源库的建设》和2014中央引导地方科技发展专项《境外珍稀热带、亚热带经济植物种质资源库的完善及其种子库和种子标本馆建设》共计600万元资金的资助下，“热带、亚热带植物种质资源库”于2016年在厦门华侨亚热带植物引种园建成。种质资源库主要从事从事国（境）内外及本土特色果树、粮食蔬菜、药用植物、经济林木、香饮植物和珍稀观赏植物种质资源的收集鉴定、保存保育、标本制作以及种子收集等工作，截止2019年6月，种质资源库共收集非洲马铃果、非洲加纳籽、绞股蓝、叶下珠、台湾番木瓜、星苹果、藜麦、以及野生蕨类植物、野菜等特色活植物600余种，制作标本500多份，保存种子400多份。

植物种质资源库有；药用植物资源圃5000多平方米，玻璃温2座（1000平方米），标本室2间（平米），种子库间（平米），相关科研仪器包括种子重力分选仪，超低温种子存储柜，低温低湿种子存储柜，研究级立体显微镜（Leica M165C），切片机，标本烘干箱等种子和标本研究、制作仪器。